European Union flag

1.1 Osnove molekularne biologije

Uvod

Molekula DNA ili deoksiribonukleinska kiselina jest molekula koji nosi nasljednu uputu za razvoj svakoga organizma te mnogih virusa. Iako nisu poznavali molekularnu osnovu nasljeđivanja, ljudi su odavno primijetili da se određene osobine nasljeđuju s roditelja na potomke. Kokoši su imale kokoši kao potomke, a iz žira bi uvijek izrastao novi hrast. Nasljedna uputa bila je sačuvana i omogućila je jedan neprekidni životni niz koji danas nastavljaju organizmi milijuna vrsta na Zemlji. Razmislite i raspravite o razlikama u prenošenju nasljedne upute kojom nastaju jednojajčani blizanci te kojom tijekom evolucije nastaju različite vrste organizama.


Slika 1.1.1.: Jednojajčani ili monozigotni blizanci nastaju iz jedne zigote i primjer su organizama koji dijele identični genom.

Molekula DNA ili molekula deoksiribonukleinske kiseline nosi nasljednu uputu.
DNA nosi nasljednu uputu za razvoj svakoga organizma i mnogih virusa
Ljudi su odavno primijetili: 

  • da se određene osobine nasljeđuju s roditelja na potomke
  • kokoši su imale kokoši kao potomke
  • iz žira bi uvijek izrastao novi hrast.

Nasljedna uputa bila je sačuvana i omogućila je jedan neprekidni životni niz.
Zahvaljujući nasljednoj uputi životni niz danas nastavljaju organizmi milijuna vrsta na Zemlji. 


Razmislite i raspravite o razlikama u prenošenju nasljedne upute: 

  • kojom nastaju jednojajčani blizanci
  • kojom tijekom evolucije nastaju različite vrste organizama.
     

Vidimo portret dviju blizanki. Djevojčice su gotovo iste. Obje imaju isti oblik lica, očiju, nosa i usana. Boja kose im je jednako žuta, oči jednako plave, obrve svijetle, jedva zamjetljive, a ten lica im je svijetao. Djeluje kao da se radi o jednoj te istoj djevojčici u drugome položaju glave.

Slika 1.1.1.: Jednojajčani ili monozigotni blizanci nastaju iz jedne zigote i primjer su organizama koji dijele identični genom.

 

Molekula DNA temelj je nasljeđivanja

Kad govorimo o temelju nasljeđivanja, često spominjemo gene. Oni su dio molekule DNA i nositelji su nasljedne upute za mnoge osobine koje organizmi nasljeđuju od svojih roditelja. Svaka molekula DNA osim gena sadrži i mnoge nekodirajuće regije. Genetika je grana biologije unutar koje se određuje koje se osobine organizma nasljeđuju i kako se nasljeđuju.

Istražite kako je nasljedna uputa ustrojena unutar nekoga organizma. 

Kliknite na pojedinu razinu ustroja nasljedne tvari.

Istraživanje strukture i svojstava molekule DNA područje je grane biologije koju nazivamo molekularna biologija. Rezultati tih istraživanja imaju široku primjenu u medicini, biotehnologiji, evoluciji i drugim znanostima. Bitna primjena znanja o molekuli DNA korištena je u kriminalistici. Forenzičkim se ispitivanjima iz uzoraka krvi, sjemena, dlake, sline ili ostataka kože nađenih na mjestu zločina mogu izolirati molekule DNA. Izolirane molekule DNA zatim se mogu uspoređivati s molekulama DNA osumnjičenika. 
 

Slika 1.1.2.: Tijekom forenzičkoga uspoređivanja molekula DNA potrebno je upotrijebiti specifične enzime koji razrezuju molekule DNA na sitnije fragmente. Ti se fragmenti razdvajaju na temelju njihove veličine, čime se na kraju dobivaju specifično grupirani fragmenti poput ovih na slici. Različiti organizmi imat će različito grupirane fragmente, a što su međusobno srodniji, fragmenti će im biti sličnije raspoređeni.

 

Problemski zadatak: NESTALI TESTOVI IZ BIOLOGIJE
 

Molekularna biologija jest grana biologije čije je područje istraživanje:

  • strukture molekule DNA 
  • svojstava molekule DNA. 

Rezultati tih istraživanja imaju široku primjenu u: 

  • medicini
  • biotehnologiji
  • evoluciji i u drugim znanostima.
     

Bitna primjena znanja o molekuli DNA korištena je u kriminalistici. Forenzičkim ispitivanjima mogu se izolirati molekule DNA iz uzoraka nađenih na mjestu zločina, kao što su uzorci iz:

  • krvi
  • sjemena
  • dlake
  • sline 
  • ostataka kože. 

 

Izolirane molekule DNA zatim se mogu uspoređivati s molekulama DNA osumnjičenika.

Tijekom forenzičkoga uspoređivanja molekula DNA, potrebno je upotrijebiti specifične enzime koji razrezuju molekule DNA na sitnije fragmente. Ti se fragmenti razdvajaju na temelju njihove veličine, čime se na kraju dobivaju specifično grupirani fragmenti poput ovih na slici. Različiti organizmi imat će različito grupirane fragmente, a što su međusobno srodniji, fragmenti će im biti sličnije raspoređeni. Fragmenti na slici vidljivi su kao okomito postavljene pravokutne pločice sa svjetlećim dijelovima.

Slika 1.1.2.: Tijekom forenzičkoga uspoređivanja molekula DNA potrebno je upotrijebiti specifične enzime koji razrezuju molekule DNA na sitnije fragmente. Ti se fragmenti razdvajaju na temelju njihove veličine, čime se na kraju dobivaju specifično grupirani fragmenti poput ovih na slici. Različiti organizmi imat će različito grupirane fragmente, a što su međusobno srodniji, fragmenti će im biti sličnije raspoređeni.

 

Problemski zadatak: Nestali testovi iz biologije

U ponedjeljak ujutro, prije nastave profesorica biologije otkrila je da su joj nestali testovi koje je ostavila u kabinetu. Testovi su sigurno bili u kabinetu u petak navečer kad ih je pripremila za ponedjeljak. U subotu je troje njezinih učenika radilo projektnu nastavu u učionici iz biologije. Oni su jedini bili blizu kabineta s testovima i zbog toga su osumnjičeni za njihovu krađu…

Preuzmite ulogu detektiva koji vodi tim forenzičara. Pokušajte otkriti što se dogodilo s testovima iz biologije.

Od ravnateljice ste doznali da je u subotu u školi bilo samo šest osoba. Učenici Tina, Leo i Maksimilijan s profesoricom biologije radili su na svome projektu u učionici pokraj kabineta. U zbornici su još bili ravnateljica te razrednik osumnjičenih učenika. Ravnateljica vas je obavijestila da su u petak nakon nastave detaljno očišćene sve prostorije u školi, što znači da su preostali uzorci DNA ostavljeni u subotu. Forenzički tim pretražit će sve tri prostorije i analizirati uzorke DNA u ostatcima stanica kože i dlake koje pronađu.

Ispitajte svih šest osoba prisutnih u školi u subotu tako da kliknete na svaku od njih i pročitate njihove izjave. Usporedite pronađene ostatke DNA iz svake prostorije i otkrijte osobu odgovornu za nestanak testova.

Uzorke DNA povucite na radnu plohu, usporedite ih i odredite tko je bio prisutan u pojedinoj prostoriji. Jednom kad ste usporedili sve uzorke na plohi i ispitali sve osobe, možete pogledati rezultate dodatne analize vašeg forenzičkog tima.

U svakom trenutku možete upisati ime nekog od 6 prisutnih osoba u polje upiši krivca. Klikom na tipku Provjeri dobit ćete povratnu informaciju o tome jeste li na pravom tragu.

Dodatna analiza
1
2
3
Ravnateljica je sigurno bila u kabinetu kao i profesorica biologije. No nedostaje nam motiv. SLUČAJ JE RIJEŠEN! Ravnateljica je, igrajući se s Gretom, u subotu ostavila svoje papire za sjednicu na stolu. Daljnjim istraživanjem testovi su nađeni u ravnateljičinu uredu. Zasigurno ih je zabunom uzela nakon igranja s Gretom.
Učionica biologije
Kabinet
Zbornica

Povijest otkrića molekule DNA

Svojstva i struktura molekule DNA postali su poznati postupno tijekom duge povijesti istraživanja. 

Klikom na pojedinu godinu na vremenskoj lenti istražite bitna otkrića u povijesti istraživanja nasljeđivanja i molekule DNA.

Svojstva i struktura molekule DNA postali su poznati postupno tijekom duge povijesti istraživanja. Klikom na pojedinu godinu na vremenskoj lenti istražite bitna otkrića u povijesti istraživanja nasljeđivanja i molekule DNA.

Struktura molekule DNA

Molekula DNA (deoksiribonukleinska kiselina) jest zavijena molekula izgrađena od dva dugačka polinukleotidna lanca. Svaki je polinukleotidni lanac polimerna molekula izgrađena od velikoga broja manjih molekula – nukleotida.

Pogledajte videozapis o strukturi molekule DNA. 
 

Molekula DNA (deoksiribonukleinska kiselina) jest zavijena molekula: 

  • izgrađena od dva dugačka polinukleotidna lanca
  • svaki je polinukleotidni lanac polimerna molekula izgrađena od velikoga broja manjih molekula – nukleotida.

Pogledajte videozapis o strukturi molekule DNA. 
 

Molekula DNA na početku je prikazana kao spiralna molekula koja se sastoji od dviju spiralnih vrpci, jedna omotana oko druge. Nukleotid je prikazan na sljedeći način: šećer deoksiriboza kao peterokut u sredini, fosfatna skupina kao krug s lijeve strane deokrisiboze i dušična baza s desne. Dušične baze prikazane su jedna pored druge, redom: timin (T), citozin (C), adenin (A) i gvanin (G). Timin i citozin su prikazani kao prstenaste molekule građene od dušika, ugljika i vodika, adenin i gvanin su prikazani kao molekule građene od dva takva prstena - veće su. Jedan polinukleotidni lanac vidljiv je kao jedan nukleotid na vrhu ekrana, za koji se zatim slažu drugi nukleotidi - jedan ispod drugog. Povezuju se u lanac preko fosfata i deoksiriboze. S desne strane strše dušične baze, redom odozgo prema dolje: T, C, A, G. Parovi baza T i A povezani su dvjema vodikovim vezama koje su prikazane kao dvije isprekidane linije. Parovi baza G i C povezani su trima vodikovim vezama koje su prikazane kao tri isprekidane linije.

Replikacija molekule DNA

Bitno svojstvo molekule DNA jest da se može udvostručiti ili replicirati. Taj proces nužno prethodi diobi stanica kako bi svaka novonastala stanica imala vlastitu kopiju molekule DNA. Tijekom replikacije molekule DNA slabe vodikove veze među parovima baza pucaju i polinukleotidni se lanci razdvajaju. Svaki odvojeni lanac služi kao kalup za stvaranje novoga lanca izgrađenoga od komplementarnih dušičnih baza.
 

Slika 1.1.3.: Replikacija molekule DNA jest semikonzervativna. To znači da je novonastala molekula DNA izgrađena od jednoga starog lanca i jednoga novog lanca koji je komplementaran staromu. Nasljedna uputa ostala je sačuvana u objema molekulama DNA.

 

Promotrite videozapis o mehanizmu replikacije molekule DNA.

Bitno svojstvo molekule DNA jest da se može udvostručiti ili replicirati. 

  • Proces repliciranja nužno prethodi diobi stanica.
  • Replikacijom svaka novonastala stanica ima vlastitu kopiju molekule DNA. 

Tijekom replikacije molekule DNA:  

  • pucaju slabe vodikove veze među parovima baza 
  • razdvajaju se polinukleotidni lanci

Svaki odvojeni lanac služi kao kalup za stvaranje novoga lanca.
Novi lanac izgrađen je od komplementarnih dušičnih baza.
 

Replikacija molekule DNA jest semikonzervativna. To znači da je novonastala molekula DNA izgrađena:  -	od jednoga starog lanca -	jednoga novog lanca koji je komplementaran staromu. Nasljedna uputa ostala je sačuvana u objema molekulama DNA. Na slici se vidi kako se dvostruki lanac razdvaja, a na svakom zasebnom kraju se stvara novi.

Slika 1.1.3.: Replikacija molekule DNA jest semikonzervativna. To znači da je novonastala molekula DNA izgrađena od jednoga starog lanca i jednoga novog lanca koji je komplementaran staromu. Nasljedna uputa ostala je sačuvana u objema molekulama DNA.

 

Promotrite videozapis o mehanizmu replikacije molekule DNA.

Spiralna molekula DNA prikazana je u sredini ekrana. Enzim helikaza prikazan je kao zašiljeni predmet koji razdvaja molekulu DNA na dvije trake - poput patentnog zatvarača. Zatim su prikazane odvojene trake koje prolaze kroz enzim DNA polimerazu - prikazan kao okrugli tunel. DNA polimeraza nove sitne kukice povezuje u novi traku koju zatim povezuje na onu staru. Zatim je prikazan usporeni proces DNA polimeraze - stari lanac je s gornje strane (sadrži šest nukleotida), a novi lanac nastaje s donje strane. Novi lanac već sadrži četiri nukleotida lijevo i novi, peti nukleotid se pridodaje s desna na lijevo. Zatim je prikazan usporeni pogled izdaleka. Molekula DNA plave boje se rastvara kao plavi patent. Rastvara se prema desno. Sa svaki strane otvorenog dijela plavog patenta nastaje novi, žuti patent. S gornje strane patent nastaje s lijeve strane prema desno, a s donje strane s desne prema lijevo. S donje strane se pridodaju novi, žuti patenti u fragmentima jer se mogu početi dodavati tek kad se patent dovoljno otvori prema desno.

Za kraj...

  • Molekula DNA sadrži nasljednu uputu za razvoj svakoga organizma i nekih virusa.
  • Molekula DNA sastoji se od dva spiralno zavijena lanca. Ti su lanci polimeri manjih molekula koje zovemo nukleotidi.
  • Svaki nukleotid građen je od fosfatne skupine, šećera deoksiriboze i dušične baze.
  • Molekula DNA sadrži četiri različite dušične baze: adenin (A), gvanin (G), citozin (C) i timin (T).
  • Nasuprotni lanci molekule DNA povezani su vodikovim vezama preko komplementarnih parova baza: A-T i G-C.
  • Tijekom udvostručavanja lanci molekule DNA razdvajaju se te oba lanca služe kao kalup za nastajanje novih.
     

Molekula DNA sadrži nasljednu uputu za razvoj svakoga organizma i nekih virusa.

Molekula DNA sastoji se od dva spiralno zavijena lanca.
Ti su lanci polimeri manjih molekula koje zovemo nukleotidi.

Svaki nukleotid građen je od: 

  • fosfatne skupine
  • šećera deoksiriboze
  • dušične baze.

Molekula DNA sadrži četiri različite dušične baze: 

  • adenin (A)
  • gvanin (G)
  • citozin (C) i 
  • timin (T).

Nasuprotni lanci molekule DNA povezani su vodikovim vezama preko komplementarnih parova baza: A-T i G-C.

Tijekom udvostručavanja lanci se molekule DNA razdvajaju.
Oba lanca služe kao kalup za nastajanje novih, komplementarnih lanaca.
 

1/5

Koju ulogu ima enzim helikaza tijekom replikacije DNA? (Jedan je točan odgovor.)

2/5

Koji su parovi baza u molekuli DNA međusobno komplementarni? (Dva su točna odgovora.)

3/5

Na slici je prikazana dušična baza molekule DNA. Upiši u prazno polje naziv označene dušične baze.

×

Ispravan odgovor:

Na slici je prikazana dušična baza molekule DNA. Upiši u prazno polje naziv označene dušične baze.

4/5

Nukleotidi molekule DNA povezani su kovalentnom vezom u istome lancu, a vodikovim vezama s nukleotidima nasuprotnog lanca.

5/5

U nekoj je molekuli DNA pokusom određen brojčani udio dušične baze timina 33 %. Koliki je brojčani udio ostalih dušičnih baza u toj molekuli DNA?
udio adenina ×
udio gvanina ×
udio citozina ×

Ispravan odgovor:

U nekoj je molekuli DNA pokusom određen brojčani udio dušične baze timina 33 %. Koliki je brojčani udio ostalih dušičnih baza u toj molekuli DNA?
udio adenina
udio gvanina
udio citozina

1.2 Od DNA do proteina 1.1 Osnove molekularne biologije